شبح در پوسته: S.A.C. 2nd GIG - یازده فردی

سال 2030 است. شش ماه از حل حادثه مرد خندان می‌گذرد. حدود 3 میلیون پناهنده در ژاپن زندگی می‌کنند که برای پر کردن کمبود نیروی کار دعوت شده‌اند. با این حال، حضور اضطراری پناهندگان دعوت‌شده، تنش‌ها با "فردگرایان" که خواستار انزوا ملی بودند، را تشدید کرد و این امر منجر به افزایش حملات تروریستی شد. در این شرایط، گروهی تروریستی به نام یازده فردی یک حمله انتحاری انجام می‌دهد. اما پشت این اقدام یک طرح بزرگتر وجود دارد. وقتی بخش 9 این را متوجه می‌شود، سعی می‌کند طراح اصلی حادثه را شناسایی کند. در همین حال، کوزه، یکی از اعضای بازمانده یازده فردی، به یک رهبر کاریزماتیک پناهندگان دعوت‌شده تبدیل می‌شود و تنش‌ها را علیه دولت تشدید می‌کند. و موتوکو احساس عجیبی از سرنوشت که او را به کوزه متصل می‌کند، شروع به احساس کردن می‌کند...